Does a peptide bound to a monoclonal antibody always adopt a unique conformation? - Institut Pasteur Access content directly
Journal Articles Research in Immunology Year : 1998

Does a peptide bound to a monoclonal antibody always adopt a unique conformation?

Un peptide fixé à un anticorps monoclonal adopte-t-il toujours une conformation unique?

Abstract

The conformation of a synthetic undecapeptide derived from the Escherichia coli tryptophan synthase beta2 subunit was studied by NMR spectroscopy when bound to a monoclonal antibody (mAb 164-2) Fab' fragment directed against the native protein. The peptide 1(H-G-R-V-G-I-Y-F-G-M-K)11, peptide 11, was recognized by the antibody and its corresponding Fab' fragments with high affinity (K(D) = 1.1+/-0.2* 10(-8) M). Peptide 11 was labelled with 15N and its structure at the binding site of the Fab' 164-2 fragment was studied by isotope-editing techniques. 1H-15N heteronuclear spectra indicated the presence of two Fab'-peptide 11 complexes with two different conformations in slow chemical exchange on the chemical shift time scale.
La conformation d'un peptide de 11 résidus issu de la sous-unité β2 de la tryptophane synthase de Escherichia coli en interaction avec le fragment Fab′ d'un anticorps monoclonal (mAb 164-2) dirigé contre la protéine native a été étudiée par spectroscopie RMN. Le peptide 1(H-G-R-V-G-I-Y-F-G-M-K)11, peptide 11, est reconnu par l'anticorps et ses fragments Fab′ avec une très forte affinité (KD = 1,1 ± 0,2*10−8 M). Le peptide 11 a été marqué par l'azote 15 et sa conformation dans le complexe formé avec les fragments Fab′ 164-2 a été étudiée par des techniques d'édition isotopique. Les spectres hétéronucléaires 1H-15N montrent qu'il existe deux complexes Fab′-peptide 11 avec deux conformations différentes en échange lent sur l'échelle des temps des déplacements chimiques.
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pasteur-00365195 , version 1 (02-03-2009)

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J. I. Guijarro, L. Djavadi-Ohaniance, F. Baleux, M. Delepierre, M. E. Goldberg. Does a peptide bound to a monoclonal antibody always adopt a unique conformation?. Research in Immunology, 1998, 149 (2), pp.127-37. ⟨10.1016/S0923-2494(98)80296-4⟩. ⟨pasteur-00365195⟩

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PASTEUR CNRS
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