The evolving SARS-CoV-2 epidemic in Africa: Insights from rapidly expanding genomic surveillance
Houriiyah Tegally
,
James San
,
Matthew Cotten
,
Monika Moir
,
Bryan Tegomoh
,
Gerald Mboowa
,
Darren Martin
,
Cheryl Baxter
,
Arnold Lambisia
,
Amadou Diallo
(1)
,
Daniel Amoako
,
Moussa Diagne
(1)
,
Abay Sisay
,
Abdel-Rahman Zekri
,
Abdou Salam Gueye
,
Abdoul Sangare
,
Abdoul-Salam Ouedraogo
,
Abdourahmane Sow
,
Abdualmoniem Musa
,
Abdul Sesay
,
Abe Abias
,
Adam Elzagheid
,
Adamou Lagare
(2)
,
Adedotun-Sulaiman Kemi
,
Aden Elmi Abar
,
Adeniji Johnson
,
Adeola Fowotade
,
Adeyemi Oluwapelumi
,
Adrienne Amuri
,
Agnes Juru
,
Ahmed Kandeil
,
Ahmed Mostafa
,
Ahmed Rebai
,
Ahmed Sayed
,
Akano Kazeem
,
Aladje Balde
,
Alan Christoffels
,
Alexander Trotter
,
Allan Campbell
,
Alpha Keita
(3, 4)
,
Amadou Kone
,
Amal Bouzid
,
Amal Souissi
,
Ambrose Agweyu
,
Amel Naguib
,
Ana Gutierrez
,
Anatole Nkeshimana
,
Andrew Page
,
Anges Yadouleton
,
Anika Vinze
,
Anise Happi
,
Anissa Chouikha
(5, 6)
,
Arash Iranzadeh
,
Arisha Maharaj
,
Armel Batchi-Bouyou
,
Arshad Ismail
,
Augustina Sylverken
,
Augustine Goba
,
Ayoade Femi
,
Ayotunde Sijuwola
,
Baba Marycelin
,
Babatunde Salako
,
Bamidele Oderinde
,
Bankole Bolajoko
,
Bassirou Diarra
,
Belinda Herring
,
Benjamin Tsofa
,
Bernard Lekana-Douki
,
Bernard Mvula
,
Berthe-Marie Njanpop-Lafourcade
,
Blessing Marondera
,
Bouh Abdi Khaireh
,
Bourema Kouriba
,
Bright Adu
,
Brigitte Pool
,
Bronwyn Mcinnis
,
Cara Brook
(7, 8)
,
Carolyn Williamson
,
Cassien Nduwimana
,
Catherine Anscombe
,
Catherine Pratt
,
Cathrine Scheepers
,
Chantal Akoua-Koffi
,
Charles Agoti
,
Chastel Mapanguy
,
Cheikh Loucoubar
(1)
,
Chika Onwuamah
,
Chikwe Ihekweazu
,
Christian Malaka
(9)
,
Christophe Peyrefitte
(1)
,
Chukwa Grace
,
Chukwuma Omoruyi
,
Clotaire Rafaï
,
Collins Morang’a
,
Cyril Erameh
,
Daniel Lule
,
Daniel Bridges
,
Daniel Mukadi-Bamuleka
,
Danny Park
,
David Rasmussen
,
David Baker
,
David Nokes
,
Deogratius Ssemwanga
,
Derek Tshiabuila
,
Dominic Amuzu
,
Dominique Goedhals
,
Donald Grant
,
Donwilliams Omuoyo
,
Dorcas Maruapula
,
Dorcas Wanjohi
,
Ebenezer Foster-Nyarko
,
Eddy Lusamaki
(10, 11, 4)
,
Edgar Simulundu
,
Edidah Ong’era
,
Edith Ngabana
,
Edward Abworo
,
Edward Otieno
,
Edwin Shumba
,
Edwine Barasa
,
El Bara Ahmed
,
Elhadi Ahmed
,
Emmanuel Lokilo
,
Enatha Mukantwari
,
Eromon Philomena
,
Essia Belarbi
,
Etienne Simon-Loriere
(12)
,
Etilé Anoh
,
Eusebio Manuel
,
Fabian Leendertz
,
Fahn Taweh
,
Fares Wasfi
(5, 6)
,
Fatma Abdelmoula
,
Faustinos Takawira
,
Fawzi Derrar
(13)
,
Fehintola Ajogbasile
,
Florette Treurnicht
,
Folarin Onikepe
,
Francine Ntoumi
,
Francisca Muyembe
,
Frank Ragomzingba
,
Fred Dratibi
,
Fred-Akintunwa Iyanu
,
Gabriel Mbunsu
,
Gaetan Thilliez
,
Gemma Kay
,
George Akpede
,
Gert van Zyl
,
Gordon Awandare
,
Grace Kpeli
,
Grit Schubert
,
Gugu Maphalala
,
Hafaliana Ranaivoson
(8)
,
Hannah Omunakwe
,
Harris Onywera
,
Haruka Abe
,
Hela Karray
,
Hellen Nansumba
,
Henda Triki
(5, 6)
,
Herve Albéric Adje Kadjo
(14)
,
Hesham Elgahzaly
,
Hlanai Gumbo
,
Hota Mathieu
,
Hugo Kavunga-Membo
,
Ibtihel Smeti
,
Idowu Olawoye
,
Ifedayo Adetifa
,
Ikponmwosa Odia
,
Ilhem Boutiba Ben Boubaker
,
Iluoreh Ahmed Muhammad
,
Isaac Ssewanyana
,
Isatta Wurie
,
Iyaloo Konstantinus
,
Jacqueline Wemboo Afiwa Halatoko
,
James Ayei
,
Janaki Sonoo
,
Jean-Claude Makangara
,
Jean-Jacques Tamfum
,
Jean-Michel Heraud
(1, 8)
,
Jeffrey Shaffer
,
Jennifer Giandhari
,
Jennifer Musyoki
,
Jerome Nkurunziza
,
Jessica Uwanibe
,
Jinal Bhiman
,
Jiro Yasuda
,
Joana Morais
,
Jocelyn Kiconco
,
John Sandi
,
John Huddleston
,
John Odoom
,
John Morobe
,
John Gyapong
,
John Kayiwa
,
Johnson Okolie
,
Joicymara Xavier
,
Jones Gyamfi
,
Joseph Wamala
,
Joseph Bonney
,
Joseph Nyandwi
,
Josie Everatt
,
Joweria Nakaseegu
,
Joyce Ngoi
,
Joyce Namulondo
,
Judith Oguzie
,
Julia Andeko
,
Julius Lutwama
,
Juma Mogga
,
Justin O’grady
,
Katherine Siddle
,
Kathleen Victoir
(15)
,
Kayode Adeyemi
,
Kefentse Tumedi
,
Kevin Carvalho
,
Khadija Said Mohammed
,
Koussay Dellagi
(15)
,
Kunda Musonda
,
Kwabena Duedu
,
Lamia Fki-Berrajah
,
Lavanya Singh
,
Lenora Kepler
,
Leon Biscornet
,
Leonardo de Oliveira Martins
,
Lucious Chabuka
,
Luicer Olubayo
,
Lul Deng Ojok
,
Lul Lojok Deng
,
Lynette Ochola-Oyier
,
Lynn Tyers
,
Madisa Mine
,
Magalutcheemee Ramuth
,
Maha Mastouri
,
Mahmoud Elhefnawi
,
Maimouna Mbanne
(1)
,
Maitshwarelo Matsheka
,
Malebogo Kebabonye
,
Mamadou Diop
(1)
,
Mambu Momoh
,
Maria da Luz Lima Mendonça
,
Marietjie Venter
,
Marietou Paye
,
Martin Faye
(1)
,
Martin Nyaga
,
Mathabo Mareka
,
Matoke-Muhia Damaris
,
Maureen Mburu
,
Maximillian Mpina
,
Michael Owusu
,
Michael Wiley
,
Mirabeau Tatfeng
,
Mitoha Ondo’o Ayekaba
,
Mohamed Abouelhoda
,
Mohamed Amine Beloufa
(13)
,
Mohamed Seadawy
,
Mohamed Khalifa
,
Mooko Marethabile Matobo
,
Mouhamed Kane
(1)
,
Mounerou Salou
,
Mphaphi Mbulawa
,
Mulenga Mwenda
,
Mushal Allam
,
My Phan
,
Nabil Abid
,
Nadine Rujeni
,
Nadir Abuzaid
,
Nalia Ismael
,
Nancy Elguindy
,
Ndeye Marieme Top
(1)
,
Ndongo Dia
(1)
,
Nédio Mabunda
,
Nei-Yuan Hsiao
,
Nelson Boricó Silochi
,
Ngiambudulu Francisco
,
Ngonda Saasa
,
Nicholas Bbosa
,
Nickson Murunga
,
Nicksy Gumede
,
Nicole Wolter
,
Nikita Sitharam
,
Nnaemeka Ndodo
,
Nnennaya Ajayi
,
Noël Tordo
(16)
,
Nokuzola Mbhele
,
Norosoa Razanajatovo
(8)
,
Nosamiefan Iguosadolo
,
Nwando Mba
,
Ojide Kingsley
,
Okogbenin Sylvanus
,
Oladiji Femi
,
Olubusuyi Adewumi
,
Olumade Testimony
,
Olusola Ogunsanya
,
Oluwatosin Fakayode
,
Onwe Ogah
,
Ope-Ewe Oludayo
,
Ousmane Faye
(1)
,
Pamela Smith-Lawrence
,
Pascale Ondoa
,
Patrice Combe
(17)
,
Patricia Nabisubi
,
Patrick Semanda
,
Paul Oluniyi
,
Paulo Arnaldo
,
Peter Kojo Quashie
,
Peter Okokhere
,
Philip Bejon
,
Philippe Dussart
(8)
,
Phillip Bester
,
Placide Mbala
,
Pontiano Kaleebu
,
Priscilla Abechi
,
Rabeh El-Shesheny
,
Rageema Joseph
,
Ramy Karam Aziz
,
René Essomba
,
Reuben Ayivor-Djanie
,
Richard Njouom
(18)
,
Richard Phillips
,
Richmond Gorman
,
Robert Kingsley
,
Rosa Maria D. E. S. A. Neto Rodrigues
,
Rosemary Audu
,
Rosina Carr
,
Saba Gargouri
,
Saber Masmoudi
,
Sacha Bootsma
,
Safietou Sankhe
(1)
,
Sahra Isse Mohamed
,
Saibu Femi
,
Salma Mhalla
,
Salome Hosch
,
Samar Kamal Kassim
,
Samar Metha
,
Sameh Trabelsi
,
Sara Hassan Agwa
,
Sarah Wambui Mwangi
,
Seydou Doumbia
,
Sheila Makiala-Mandanda
,
Sherihane Aryeetey
,
Shymaa Ahmed
,
Side Mohamed Ahmed
,
Siham Elhamoumi
,
Sikhulile Moyo
,
Silvia Lutucuta
,
Simani Gaseitsiwe
,
Simbirie Jalloh
,
Soa Fy Andriamandimby
(8)
,
Sobajo Oguntope
,
Solène Grayo
(16)
,
Sonia Lekana-Douki
,
Sophie Prosolek
,
Soumeya Ouangraoua
,
Stephanie van Wyk
,
Stephen Schaffner
,
Stephen Kanyerezi
,
Steve Ahuka-Mundeke
,
Steven Rudder
,
Sureshnee Pillay
,
Susan Nabadda
,
Sylvie Behillil
(19)
,
Sylvie Budiaki
,
Sylvie van der Werf
(19)
,
Tapfumanei Mashe
,
Thabo Mohale
,
Thanh Le-Viet
,
Thirumalaisamy Velavan
,
Tobias Schindler
,
Tongai Maponga
,
Trevor Bedford
,
Ugochukwu Anyaneji
,
Ugwu Chinedu
,
Upasana Ramphal
,
Uwem George
,
Vincent Enouf
(19)
,
Vishvanath Nene
,
Vivianne Gorova
,
Wael Roshdy
,
Wasim Abdul Karim
,
William Ampofo
,
Wolfgang Preiser
,
Wonderful Choga
,
Yahaya Ali Ahmed
,
Yajna Ramphal
,
Yaw Bediako
,
Yeshnee Naidoo
,
Yvan Butera
,
Zaydah de Laurent
,
Ahmed Ouma
,
Anne von Gottberg
,
George Githinji
,
Matshidiso Moeti
,
Oyewale Tomori
,
Pardis Sabeti
,
Amadou Sall
(1)
,
Samuel Oyola
,
Yenew Tebeje
,
Sofonias Tessema
,
Tulio de Oliveira
,
Christian Happi
,
Richard Lessells
,
John Nkengasong
,
Eduan Wilkinson
,
Aaron Shibemba
,
Abasi Ene Obong
,
Abayomi Fadeyi
,
Abbad Anas
,
Abd Elazeez Shabaan
,
Abd Monaem Adel
,
Abd Moniem Ain Shoka
,
W. Abdelhamid
,
Abdelilah Laraqui
,
Abdelkader Laatiris
,
Abdelkrim Meziane Bellefquih
,
Abdellah Faouzi
,
F. Abdelmoulah
,
Abdelomunim Essabbar
,
Abderrahmane Bimouhen
,
Abderraouf Hilali
,
I. Abdo
,
Abdou Padane
,
Abdoul Karim Sangaré
,
Abdoul Karim Soumah
,
Abdoulaye Djimde
,
Abdoulaye Toure
,
Abdoulie Kanteh
,
Abdulla Bashein
,
Abdullah Salama
,
Abe Lojuan
,
Abebe Genetu Bayih
,
Abel Abera Negash
,
Abel Lissom
,
N. Abid
,
Abla Konou
,
Abo Shama
,
O. Abosede
,
S. Abouelnaga
,
Abraham Ali
,
Abraham Kwabena Anang
,
Abraham Tesfaye
,
Adam Khan
,
Adamu Tayachew
,
Adane Mihret
,
Adba Alfatih Alemam
,
Adede Hawi
,
A. Adesegun
,
Adey Feleke Desta
,
Adib Ghassan
,
Adjaratou Traoré
,
B. Adjiratou Aissatou
,
Adodo Sadji
,
Adrian Egli
,
Adriano Mendes
,
Adugna Abera
,
Adul Candé
,
Afaf Alaoui
,
Afonso Pedro
,
B. Agbodzi
,
A.M. Ageez
,
Ahidjo Ayouba
,
Ahlam Alarif
,
Ahmed Kayed
,
Ahmed El-Taweel
,
Ahmed Elsayed
,
Ahmed Gad
,
Ahmed Fakhfakh
,
Ahmed Kandeil
,
M. Ahmed
,
Ahmed Mostafa
,
O. Ahmed
,
Ahmed Reggad
,
Ahmed Taha
,
Ahyong Vida
,
Aicha Bensalem
,
Aida Sivro
,
Aissam Hachid
,
F. Ajili
,
F.V. Ajogbasile
,
Akim Adegnika
,
Akoele Siliadin
,
Akwii Patience Natasha
,
Aladje Balde
,
Alan Lemtudo
,
Alaoui Sanaa-Amine
,
A. Alaruusi
,
Alassane Ouro-Medeli
,
Albert Nyunja
,
Alberto Rizzo
,
Alemseged Abdissa
,
Alemu Tike Debela
,
Alessandro Mancon
,
Alessandro Marcello
,
Alexander Goredema
,
Alexander Greninger
,
Alexis Ndjolo
,
Alexis Niyomwungere
,
Alfredo Mari
,
Alfredo Mayor
,
M.A. Ali
,
Ali Zumla
,
Alia Ben Kahla
,
Alia Grad
,
Alice Kabanda
,
Alie Tia
,
Alimou Camara
,
Alimuddin Zumla
,
Alle Baba Dieng
,
Almoustapha Maiga
,
Amadou Alpha Sall
,
Amadou Daou
,
Amal Naguib
,
Amal Souiri
,
Amal Zouaki
,
Amalou Ghita
,
Amandine Mveang-Nzoghe
,
Amariane Koné
,
Amariane Koné
,
Ambroise Ahouidi
,
Amel Benyahia
,
Amel Nagiub
,
K. Amer
,
Ameyo Dorkenoo
,
Amina Barkat
,
Aminata Dia
,
Aminata Mbaye
,
Aminata Mboup
,
Aminata Sileymane Thiam
,
Amine Idriss Lahlou
,
Amira Suliaman Wadi
,
Amivi Ehlan
,
Amujal Marion
,
Amuri Aziza
,
Amy Strydom
,
Anass Abbad
,
Anatole Nkeshimana
,
Andargachew Mulu
,
Anderrahmane Maaroufi
,
Andrea Luquette
,
Andreas Shiningavamwe
,
Andres Moreira-Soto
,
Andrew Azman
,
Andrew Bennett
,
Andrew Tarupiwa
,
Anga Latifa
,
Ange Badjo
,
Angel Angelov
,
Angela Brisebarre
,
Angela Detweiler
,
Angoune Ndong
,
Anja Werno
,
Anna Julienne Selbe Ndiaye
,
Anna-Lena Sander
,
B. Annajr
,
Annamaria d'Aprile
,
Anne van der Linden
,
Annemiek van der Eijk
,
Annette Erhart
,
Anou Somboro
,
Anoumou Dagnran
,
Anthony Ahumibe
,
Anthony Levasseur
,
Antje van der Linden
,
Antoine Dara
,
Anu Jegede-Williams
,
M. Aouni
,
A. Arjarquah
,
Arlene Uwituze
,
Arlo Upton
,
Armel Poda
,
Arsène Somé
,
Arsène Zongo
,
Arsenia Massinga
,
K.M. Asare
,
Ashaba Fred Katabazi
,
Asma Ferjani
,
Assane Dieng
,
Astou Gaye-Gaye
,
N. Atiga
,
Atsbeha Weldemariam
,
Augustina Arjaquah
,
A. Auld
,
Awa Ba-Diallo
,
Awatef Elmoussi
,
Awunyo Sena
,
Aya Mohamed
,
Ayman Farghaly
,
B. Ayo-Ale
,
F. Ayoade
,
Ayola Akim Adegnika
,
Ayong More
,
Ayorinde Babatunde James
,
Azami Nawfel
,
Azaria Diergaardt
,
Azuka Patrick Okwuraiwe
,
Babafemi Taiwo
,
S. Baboo
,
B. Bahadoor
,
A.A. Bahnassy
,
Bakary Sanyang
,
U. Bakry
,
Bamba Fatoumata Touré
,
Bamidele Iwalokun
,
R. Banda
,
S. Bane
,
Bankole Johnson
,
Barada Cisse
,
Barbra Murwira
,
Bas Oude Munnink
,
Armel Batchi-Bouyou
,
R. Batra
,
Beatrice Dhaala
,
Belayachi Lamiae
,
A.B. Belkhir
,
I. Ben Ayed
,
Ben Morton
,
Ben Moussa
,
Ben Wulf
,
Bénédicte Ndeboko
,
Benhida Rachid
,
Benjamiin Lindsey
,
Benjamin Foulkes
,
Benjamin Hounkpatin
,
Benjamin Selekon
,
M. Bensaid
,
Bernard Mpairwe
,
Bernard Ssentalo Bagaya
,
Bert Vanmechelen
,
Bertrand Lell
,
Beth Mutai
,
Bethlehem Adnew
,
Beuty Makamure
,
B. Bighignoli
,
Birahim Piere Ndiaye
,
Bishwo Adhikari
,
S.M. Bitrou
,
Blaise Mboringong Akenji
,
Bode Shobayo
,
Boitumelo Zuze
,
Bonifacio Manguire Nlavo
,
Bouchra Belfquih
,
Bouchra Boujemla
,
Bouna Yatassaye
,
Bouzidi Aymane
,
Brian Andika
,
Bright Yemi
,
Bronwyn Kleinhans
,
Bruna Galvao
,
Bubacar Delgado Pinto Embaló
,
Bulelani Manene
,
Butoyi Pascal
,
Camille Capel
,
Campbell Anu
,
Carine Tchibozo
,
Carla Madeira
,
Carlos Cortes
,
Carniel Elisabeth
,
Carol Kifude
,
Carolle Yanique Tayimetha
,
Catherine Arnold
,
Catherine Okoi
,
Cecilia Waruhiu
,
Celestin Godwe
,
Celestina Obiekea
,
Celine Nkenfou
,
L. Chabuka
,
Chakib Nejjari
,
H. Chambaro
,
D. Chanda
,
K. Changula
,
Charifa Drissi Touzani
,
Charles Kayuki
,
Charles Nyagupe
,
Charles Ssuuna
,
Charoute Hicham
,
Chaselynn Watters
,
H. Chawech
,
Cheikh Sokhna
,
Chenaoui Mohamed
,
Chiamaka Nwuba
,
C. Chilufya
,
Chimaobi Chukwu
,
Chinyere Anyika
,
P.J. Chipimo
,
S. Chitanga
,
M. Chitenje
,
M. Chiwaula
,
Chouati Taha
,
Chris Mansell
,
Christelle Butel
,
Christian Devaux
,
Christian Drosten
,
Christian Ranaivoson
,
Christian Utpatel
,
Christophe Malabat
,
A. Chtourou
,
G. Chukwu
,
Claudia Daubenberger
,
Clement Kakai
,
Clement Masakwe
,
Clotaire Donatien Rafai
,
Collins Chenwi
,
Collins Misita
,
Collins Muli
,
Corine Geurtsvankessel
,
Corinne Maufrais
,
Coulibaly Mbegnan
,
M. Crawford
,
Cristina Tato
,
Cyrus Yiaba
,
N. d'Amore
,
Dabiri Damilari
,
Dalia Ramadan
,
D. Damena
,
Daniel Ouso
,
Daniela Pisanelli
,
Danilo Licastro
,
David Hammer
,
David Nieuwenhuijse
,
David Patrick Kateete
,
David Wilkinson
,
Davy Leger Mouangala
,
Dawit Hailu Alemayehu
,
R.M. Dawood
,
R. de Sanctis
,
Deborah Mettle
,
Demba Koita
,
Dennis Kenyi Lodiongo
,
Dennis Laryea
,
Dennis Wandera
,
Dereje Leta
,
Dersi Noureddine
,
Desire Takou
,
Dessalegn Abeje Tefera
,
Dhwani Batra
,
Dia Ndongo
,
A. Diab
,
Diabou Diagne
,
Diane Mabika
,
Diané Bamourou
,
Dianke Samaté
,
B. Diarra
,
Didier Raoult
,
Dieudonne Mutangana
,
Dineo Emang Tshiamo. Gape Nyepetsi
,
Diosdado Odjama Nseng Ada
,
Djimabi Salah
,
Donatella Cedola
,
Doris Harding
,
Dorothy Yeboah-Manu
,
Dossou Ange
,
Dowbiss Meta Djomsi
,
Dragana Drinkovic
,
C. Draper
,
Dumbuya Foday Sahr
,
Ebenezer Odewale
,
Eclou Sedjro
,
Edang-Minko Armand
,
Edgar Kigozi
,
Edith Koskei
,
Edith Nkwembe
,
Edmilson de Oliveira Filho
,
Edmira Maria da Costa
,
Edward Kiritu
,
Efrem Lim
,
Egon Ozer
,
B. Egyir
,
Ehab Abdelkader Abuelenein
,
Eitel Mpoudi Ngole
,
El Aliani Aissam
,
El Ansari Fatima Zahra
,
El Hamouchi Adil
,
El Oualid Abdelmjid
,
H. El-Shaqnqery
,
M. El-Zayat
,
Elamin Abualas
,
Elannaz Hicham
,
A. Elargoubi
,
Eleni Kidane
,
Elham Rizgalla
,
M.M. Elhoseny
,
F.W. Elhosieny
,
Elisabeth Carniel
,
Elizabeth Nyakarungu
,
S.M. Elkhateeb
,
Elmostafa Benaissa
,
Elmostafa El Fahime
,
M. Elouanass
,
M.H. Elsissy
,
Elvyre Mbongo-Nkama
,
Elwaleed Latif
,
Emame Edu
,
Emanuele Orsini
,
Emilio Skarwan
,
Emily Stefanov
,
Emmanuel Nasinghe
,
Emmanuel Nepolo
,
Emmanuel Ogunbayo
,
Emmanuelle Munger
,
Emmanuelle Permal
,
Emna Gaies
,
H. Ennibi
,
Ennibi Khalid
,
Erasmus Kotey
,
Erasmus Smit
,
Eric Lelo
,
Eric Adu
,
Eric Delaporte
,
Eric Katagirya
,
Eric Kezakarayagwa
,
Eric Muthanje
,
Erica Luis Maria Magalhães
,
Ernest Asiedu
,
Esemu Livo
,
Esperance Umumararungu
,
Esther Chitechi
,
Esther Omuseni
,
Etoundi Mballa Alain
,
Evelyn Bonney Quansah
,
Evelyn Bonney
,
M.H. Ezzelarab
,
Faatu Cassama
,
Fabien Roch Niama
,
Fabio Arena
,
G. Faggioni
,
E. Fahsbender
,
Faith Sigei
,
Faouzi Abdellah
,
Farah Jouali
,
H. Farawyla
,
Farida Hilali
,
Fatima Chgouri
,
Fatima El Falaki
,
Fatima Zahra El Ansari
,
Fatma Ebied
,
Fatna Bssaibis
,
Fattah Al Onifade
,
Faye Ousmane
,
Fayez Ahmed Khardine
,
Fayez Khardine
,
A.V. Fedorov
,
Fekadu Alemu
,
Fekkak Jamal
,
Fengming Sun
,
Fetouma Doudou
,
A.E. Fikry
,
S. Fillo
,
Fiorenza Bracchitta
,
Firmin Kaboré
,
L. Fki-Berrajah
,
Flora Donati
,
Florence Fenollar
,
Foday Sahr Samuel Sorie
,
O. Folarino
,
Francine Folorunsho
,
Francisca Kabatesi
,
Francisco Muyembe-Mawete
,
François Malagon
,
Franklin Kiemdé
,
Franklyn Egbe Asiedu-Bekoe
,
Frédéric Nkongho
,
Frederick Lemoine
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R. Freitas
,
T. Fuh-Neba
,
I. Gaaloul
,
Gabriel Kabamba
,
Gadissa Gutema
,
Gaies Emna
,
Galadima Gadzama
,
Galal Mahmoud
,
Garba Ouangole
,
S. Gargouri
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R. Garry
,
Gary Mcauliffe
,
Gathii Kimita
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Gédéon Prince Manouana
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Gelanew Tesfaye
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George Awinda
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George Kyei
,
George Michuki
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Georgelin Nguema Ondo
,
Gerhard van Rooyen
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Gert Marais
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Getachew Abichu
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Getachew Tesfaye Beyene
,
Getachew Tollera
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Getnet Hailu
,
Ghamaz Hamza
,
Ghazi Kayali
,
Ghizlane El Amin
,
Gibson Mhlanga
,
Gilbert Kibet
,
Gildas Hounkanrin
,
F. Giordani
,
Gizaw Teka
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Godfrey Masete
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R. Goldstone
,
C. Gomaa
,
Gomaa Mokhtar
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Gora Lo
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B. Gosnell
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A. Gottberg
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Grace Angong Belournou
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Grace Oni
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Grace Vincent
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Gregory Wani
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Guedi Ali Barreh
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Guillermo Garcia
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Guohong Deng
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N. Guseva
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Guy Paterne Malonga Mbembo
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Guy Stéphane Padzys
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S. Gwayi
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Habiba Ben Romdhane
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Habiba Naija
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Haby Diallo
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A. Hadad
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M.M. Hafez
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Hafsia Ladhari
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Hagar Elshora
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Hailu Dadi
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Hajjaji Mohammed
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Hakima Kabbaj
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A. Halafawy
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Halidou Tinto
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Halimatou Diop Ndiaye
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Hamadi Assane
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T.N. Hamdani
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M.S. Hamdy
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R. Hassan
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Hong Xie
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Houssem Guedouar
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Hu Luo
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Huiqing Si
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Ibrahima Halilou
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Ikram Omar Osman
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Mohamed Chenaoui
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Mohamed Elhadidi
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K.S. Mohamed
,
Mohamed Kamal
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Mohamed Rhajaoui
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Mohamed Seadawy
,
Mohamed Shamel
,
Mohamed Shemis
,
K.S. Mohammed
,
Mohammed Walid Chemao Elfihri
,
Mohcine Bennani Mechita
,
Mokhtar Gomaa
,
Molalegne Bitew
,
M. Momoh
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Mona O.A. Alkarim
,
Monemo Pacome
,
Monilade Akinola
,
A. Monte
,
G. Monuir
,
M. Monze
,
M. Mooko
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,
Moreira-Soto Andres
,
Moriba Povogui
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Mosepele Mosepele
,
Moses Chilufya
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Moses Joloba
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Moses Luutu
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Mostafa Elouennass
,
Mostfa Elhoseiny
,
Mostfa Elnakib
,
Mostfa Yakout
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Mouhcine Gardoul
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Mouhssine Hemlali
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A. Mouity Matoumba
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Mouna Ben Sassi
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Mouna Safer
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Mouneem Essabbar
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Moustapha Nzamba Maloum
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Moustapha Sakho
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Moyinoluwa Odugbemi
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Muchaneta Mugabe
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Muinah Adenike Fowora
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Muntaser Eltayeb Ibrahim
,
F. Mupeta
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Murebwayire Clarisse
,
Mushal Ali
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Mushal Allam
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Mustapha Mouallif
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W. Mwangomba
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Myriam Seffar
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T. Mzumara
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N. N'Dilimabaka
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Nabila Soara
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A. Nabli
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Nadia Sitoe
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Nafisatou Leye
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A. Naguib
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K. Nalubamba
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Nandi Siegfried
,
Nardjes Hihi
,
Narjis Amar
,
E.A. Naryshkina
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Nathalia Endjala
,
Nathalia Garus-Oas
,
Nathan Kapata
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Ndack Ndiaye
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Ndahafa Frans
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N.T. Ndam
,
Ndéye Coumba Touré Kane
,
Ndiaye Ndack
,
Ndine Fainguem
,
Ndodo Nnaemeka
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Ndumbu Pentikainen
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L. Ndwiga
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Nedio Mabunda
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N. Neff
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A.A. Negash
,
Nejla Stambouli
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Z. Neto
,
A.M. Ngonga Dikongo
,
W. Ngosa
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F. Niatou-Singa
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Nicaise Ndam
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,
Nicholas Mwikwabe
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J. Nicod
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Nikki Freed
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Nischay Mishra
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Nitin Savaliya
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Noah Baker
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Noé Patrick Mbondoukwe
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Nokukhanya Mdlalose
,
Nonso Nduka
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Noura Abo Shama
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Nourlil Jalal
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Nsubuga Gideon
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N. Ntuli
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Nuro Abilio
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Nyam Itse Yusuf
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Oby Wayoro
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M. Ochwoto
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Ofonime Ebong
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L. Ofori-Boadu
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Ola Elroby
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Olabisi Olabisi
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Olajumoke Ojo
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L. Olfert
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Olin Silander
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Olusola Anuoluwapo Akanbi
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Oluwatimilehin Adewumi
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Omar Elahmer
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S. Omar
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S. Omilabu
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Omnia Kutkat
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Omoare Adesuyi
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Onalethata Lesetedi
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E. Ongera
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Ontlametse Bareng
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C.K. Onwuamah
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O. Ope-Ewe
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Osama Mansour
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F. Oteng
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Oumaima Ait Si Mohammed
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Oumy Diop
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Ouna Ouadghiri
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A. Oyefolu
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P Nthiga
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S. Palomba
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Phillip Ashton
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Tarek Aanniz
,
Tarek Refaat Elnagdy Raafat Zaher
,
Tatenda Takawira
,
C. Tato
,
D.A. Tefera
,
Tei-Maya Fred
,
Tesfaye Gelanew
,
Tesfaye Rufael
,
Thanh Le Viet
,
Thela Tefelo
,
Thérèse Kagoné
,
Thibaut Armel Cherif Gnimadi
,
K. Thiongo
,
Thomas Briese
,
Van Thomas
,
Thongbotho Mphoyakgosi
,
Thushan de Silva
,
Tim Roloff
,
Timothy Blackmore
,
Tiziana Rollo
,
Tom Lutalo
,
Tomade A.M. Ibrahim
,
T. Tombolomako
,
Tomiwa Adepetun
,
C. Tomkins-Tinch
,
Tony Wawina-Bokalanga
,
Tope Sobajo
,
Touil Nadia
,
Touria Essayagh
,
Toy Nwako
,
H. Triki
,
R. Tsiry
,
Tsiry Randriambolamanantsoa
,
Tumisang Madisa
,
M. Turki
,
C.A. Ugwu
,
Uyi Emokpae
,
Valeria Delli Carri
,
Valeria Micheli
,
G. van Rooyen
,
M. Vanaerschot
,
Vanessa Magnussen
,
Vanessa Mohr
,
Vani Sathyendran
,
Veronica Playle
,
R. Viana
,
U. Vickos
,
Victor Max Corman
,
Victor Mukonka
,
Victor Ofula
,
Vida Ahyong
,
Vincent Appiah
,
Vincent Bours
,
Violette M'Cormack
,
Virginia Hope
,
Vivi Hue-Trang Lieu
,
Vololoniaina Raharinosy
,
Wadegu Meshack
,
N. Wadonda
,
J. Wadula
,
Wael Ali
,
Waidi Sule
,
Wallace Bulimo
,
Warren Cyrus Yiaba
,
C.N. Waruhiu
,
Wasfi Fares
,
R. Webby
,
A.G. Weldemariam
,
Wendy Karen Jo
,
R. Woelfel
,
S. Wolh
,
I. Wurie
,
Xavier Crespin
,
Xiaoyun Ren
,
Xiuhua Wang
,
Ya.M. Krasnov
,
Yacine Amet Dia
,
Yacine Dia Seni Ndiaye
,
Yacob Mohamed Yusuf
,
Yacouba Sawadogo
,
Yahya Yadouleton
,
Yakob Gebregziabher Maidane
,
Yao Tsegay
,
Yasser Layibo
,
Yassine El Hady
,
Yassmin Sekhsokh
,
Yawo Moatasim
,
C. Yeboah
,
Youbi Mohammed
,
Yousif Rabih Makki
,
Youssef Akhoud
,
Yuri Ushijima
,
Yusuf Jimoh
,
Yvette Badou
,
J. Matoke D. Zablon
,
J.O. Zablon
,
Zaineb Hamzaoui
,
Zakia Regragui
,
Zara Wuduri
,
Zein Souma
,
Zeinab Ali Waberi
,
Zeinab Imam
,
Zekiba Tarnagda
,
Zemmouri Faouzia
,
J. Zhang
,
Zhenghui Li
,
Zimmerman Maiga
,
Zohour Kasmy
,
Minko Zong
,
A. Zorgani
,
Zouheir Yassine
,
Zoukaneirii Issa
,
P. Zulu
,
Zuzheng Xiang
1
Institut Pasteur de Dakar
2 CERMES - Centre de Recherche Médicale et Sanitaire [Niamey, Niger]
3 Université Gamal Abdel Nasser de Conakry
4 TransVIHMI - Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes
5 Institut Pasteur de Tunis
6 UTM - Université de Tunis El Manar
7 University of Chicago
8 Institut Pasteur de Madagascar
9 IPB - Institut Pasteur de Bangui
10 INRB - Institut National de Recherche Biomédicale [Kinshasa]
11 UNIKIN - University of Kinshasa
12 Génomique évolutive des virus à ARN - Evolutionary genomics of RNA viruses
13 Institut Pasteur d'Algérie
14 Institut Pasteur de Côte d'Ivoire
15 Direction Internationale de l'Institut Pasteur
16 Institut Pasteur de Guinée
17 Centre Hospitalier de Mayotte
18 Centre Pasteur du Cameroun
19 GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2) - Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses
2 CERMES - Centre de Recherche Médicale et Sanitaire [Niamey, Niger]
3 Université Gamal Abdel Nasser de Conakry
4 TransVIHMI - Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes
5 Institut Pasteur de Tunis
6 UTM - Université de Tunis El Manar
7 University of Chicago
8 Institut Pasteur de Madagascar
9 IPB - Institut Pasteur de Bangui
10 INRB - Institut National de Recherche Biomédicale [Kinshasa]
11 UNIKIN - University of Kinshasa
12 Génomique évolutive des virus à ARN - Evolutionary genomics of RNA viruses
13 Institut Pasteur d'Algérie
14 Institut Pasteur de Côte d'Ivoire
15 Direction Internationale de l'Institut Pasteur
16 Institut Pasteur de Guinée
17 Centre Hospitalier de Mayotte
18 Centre Pasteur du Cameroun
19 GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2) - Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses
Houriiyah Tegally
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162447
- ORCID : 0000-0002-7102-8540
James San
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162448
- ORCID : 0000-0002-5736-664X
Matthew Cotten
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162569
- ORCID : 0000-0002-3361-3351
Monika Moir
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254079
- ORCID : 0000-0003-1095-1910
Bryan Tegomoh
- Fonction : Auteur
Gerald Mboowa
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254080
- ORCID : 0000-0001-8445-9414
Darren Martin
- Fonction : Auteur
Cheryl Baxter
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254081
- ORCID : 0000-0002-6033-7655
Arnold Lambisia
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162462
- ORCID : 0000-0001-5312-0960
Amadou Diallo
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162458
- ORCID : 0000-0002-8584-9972
Daniel Amoako
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162472
- ORCID : 0000-0003-3551-3458
Abay Sisay
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254082
- ORCID : 0000-0002-6646-1868
Abdel-Rahman Zekri
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162451
- ORCID : 0000-0003-3939-0416
Abdou Salam Gueye
- Fonction : Auteur
Abdoul Sangare
- Fonction : Auteur
Abdoul-Salam Ouedraogo
- Fonction : Auteur
Abdourahmane Sow
- Fonction : Auteur
Abdualmoniem Musa
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254083
- ORCID : 0000-0003-3840-9277
Abdul Sesay
- Fonction : Auteur
Abe Abias
- Fonction : Auteur
Adam Elzagheid
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254084
- ORCID : 0000-0002-7086-5937
Adedotun-Sulaiman Kemi
- Fonction : Auteur
Aden Elmi Abar
- Fonction : Auteur
Adeniji Johnson
- Fonction : Auteur
Adeola Fowotade
- Fonction : Auteur
Adeyemi Oluwapelumi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162453
- ORCID : 0000-0002-0848-5917
Adrienne Amuri
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162454
- ORCID : 0000-0002-5516-0779
Agnes Juru
- Fonction : Auteur
Ahmed Kandeil
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254085
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Ahmed Mostafa
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254086
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Ahmed Rebai
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162455
- ORCID : 0000-0002-8954-8683
- IdRef : 150433735
Ahmed Sayed
- Fonction : Auteur
Akano Kazeem
- Fonction : Auteur
Aladje Balde
- Fonction : Auteur
Alan Christoffels
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254087
- ORCID : 0000-0002-0420-2916
Alexander Trotter
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254088
- ORCID : 0000-0001-5612-5310
Allan Campbell
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254089
- ORCID : 0000-0002-9178-1556
Amadou Kone
- Fonction : Auteur
Amal Bouzid
- Fonction : Auteur
Amal Souissi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162459
- ORCID : 0000-0003-3838-1876
Ambrose Agweyu
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254090
- ORCID : 0000-0001-8760-1279
Amel Naguib
- Fonction : Auteur
Ana Gutierrez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162460
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Anatole Nkeshimana
- Fonction : Auteur
Andrew Page
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162461
- ORCID : 0000-0001-6919-6062
Anges Yadouleton
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254091
- ORCID : 0000-0001-8346-7439
Anika Vinze
- Fonction : Auteur
Anise Happi
- Fonction : Auteur
Anissa Chouikha
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254092
- ORCID : 0000-0001-5616-0204
Arash Iranzadeh
- Fonction : Auteur
Arisha Maharaj
- Fonction : Auteur
Armel Batchi-Bouyou
- Fonction : Auteur
Arshad Ismail
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162463
- ORCID : 0000-0003-4672-5915
Augustina Sylverken
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162465
- ORCID : 0000-0002-7691-914X
Augustine Goba
- Fonction : Auteur
Ayoade Femi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162466
- ORCID : 0000-0002-6599-3109
Ayotunde Sijuwola
- Fonction : Auteur
Baba Marycelin
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254093
- ORCID : 0000-0002-1004-1717
Babatunde Salako
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254094
- ORCID : 0000-0002-0963-7302
Bamidele Oderinde
- Fonction : Auteur
Bankole Bolajoko
- Fonction : Auteur
Bassirou Diarra
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162477
- ORCID : 0000-0002-1795-9379
Belinda Herring
- Fonction : Auteur
Benjamin Tsofa
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254095
- ORCID : 0000-0003-1000-1771
Bernard Lekana-Douki
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254096
- ORCID : 0000-0002-9417-1358
Bernard Mvula
- Fonction : Auteur
Berthe-Marie Njanpop-Lafourcade
- Fonction : Auteur
Blessing Marondera
- Fonction : Auteur
Bouh Abdi Khaireh
- Fonction : Auteur
Bourema Kouriba
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162565
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Bright Adu
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254097
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Brigitte Pool
- Fonction : Auteur
Bronwyn Mcinnis
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162467
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Cara Brook
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1159737
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Carolyn Williamson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162566
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Cassien Nduwimana
- Fonction : Auteur
Catherine Anscombe
- Fonction : Auteur
Catherine Pratt
- Fonction : Auteur
- PersonId : 822763
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Cathrine Scheepers
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162468
- ORCID : 0000-0002-1683-0282
Chantal Akoua-Koffi
- Fonction : Auteur
Charles Agoti
- Fonction : Auteur
Chastel Mapanguy
- Fonction : Auteur
Chika Onwuamah
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162531
- ORCID : 0000-0002-5111-1822
Chikwe Ihekweazu
- Fonction : Auteur
Christian Malaka
- Fonction : Auteur
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Chukwa Grace
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254099
- ORCID : 0000-0001-5273-045X
Chukwuma Omoruyi
- Fonction : Auteur
Clotaire Rafaï
- Fonction : Auteur
Collins Morang’a
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162470
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Cyril Erameh
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162532
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Daniel Lule
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162473
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Daniel Bridges
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162567
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Daniel Mukadi-Bamuleka
- Fonction : Auteur
Danny Park
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162474
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David Rasmussen
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162450
- ORCID : 0000-0001-9457-7561
David Baker
- Fonction : Auteur
David Nokes
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162471
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Deogratius Ssemwanga
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162475
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Derek Tshiabuila
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162476
- ORCID : 0000-0001-5221-2126
Dominic Amuzu
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162478
- ORCID : 0000-0002-8920-0708
Dominique Goedhals
- Fonction : Auteur
Donald Grant
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254100
- ORCID : 0000-0002-4329-0795
Donwilliams Omuoyo
- Fonction : Auteur
Dorcas Maruapula
- Fonction : Auteur
Dorcas Wanjohi
- Fonction : Auteur
Ebenezer Foster-Nyarko
- Fonction : Auteur
Edgar Simulundu
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162480
- ORCID : 0000-0001-9423-0816
Edidah Ong’era
- Fonction : Auteur
Edith Ngabana
- Fonction : Auteur
Edward Abworo
- Fonction : Auteur
Edward Otieno
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254101
- ORCID : 0000-0002-8014-7306
Edwin Shumba
- Fonction : Auteur
Edwine Barasa
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254102
- ORCID : 0000-0001-5793-7177
El Bara Ahmed
- Fonction : Auteur
Elhadi Ahmed
- Fonction : Auteur
Emmanuel Lokilo
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162482
- ORCID : 0000-0001-7581-9801
Enatha Mukantwari
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162483
- ORCID : 0000-0002-4381-2098
Eromon Philomena
- Fonction : Auteur
Essia Belarbi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162484
- ORCID : 0000-0002-9531-818X
Etienne Simon-Loriere
- Fonction : Auteur
- PersonId : 734968
- IdHAL : etiennesimon-loriere
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Etilé Anoh
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162485
- ORCID : 0000-0002-3174-3574
Eusebio Manuel
- Fonction : Auteur
Fabian Leendertz
- Fonction : Auteur
Fahn Taweh
- Fonction : Auteur
Fares Wasfi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 772219
- ORCID : 0000-0002-0452-2856
Fatma Abdelmoula
- Fonction : Auteur
Faustinos Takawira
- Fonction : Auteur
Fawzi Derrar
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162487
- ORCID : 0000-0002-3968-4820
Fehintola Ajogbasile
- Fonction : Auteur
Florette Treurnicht
- Fonction : Auteur
Folarin Onikepe
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162489
- ORCID : 0000-0001-7283-2920
Francine Ntoumi
- Fonction : Auteur
Francisca Muyembe
- Fonction : Auteur
Frank Ragomzingba
- Fonction : Auteur
Fred Dratibi
- Fonction : Auteur
Fred-Akintunwa Iyanu
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254103
- ORCID : 0000-0001-8525-6213
Gabriel Mbunsu
- Fonction : Auteur
Gaetan Thilliez
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162491
- ORCID : 0000-0001-8650-4477
Gemma Kay
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162492
- ORCID : 0000-0002-1176-8459
George Akpede
- Fonction : Auteur
Gert van Zyl
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162493
- ORCID : 0000-0003-3021-5101
Gordon Awandare
- Fonction : Auteur
Grace Kpeli
- Fonction : Auteur
Grit Schubert
- Fonction : Auteur
Gugu Maphalala
- Fonction : Auteur
Hafaliana Ranaivoson
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162494
- ORCID : 0000-0002-7161-5083
Hannah Omunakwe
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254104
- ORCID : 0000-0002-5146-5890
Harris Onywera
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254105
- ORCID : 0000-0002-7298-4921
Haruka Abe
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254106
- ORCID : 0000-0003-0141-5059
Hela Karray
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162496
- ORCID : 0000-0001-8029-7761
Hellen Nansumba
- Fonction : Auteur
Hesham Elgahzaly
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254107
- ORCID : 0000-0002-9327-286X
Hlanai Gumbo
- Fonction : Auteur
Hota Mathieu
- Fonction : Auteur
Hugo Kavunga-Membo
- Fonction : Auteur
Ibtihel Smeti
- Fonction : Auteur
Idowu Olawoye
- Fonction : Auteur
Ifedayo Adetifa
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254108
- ORCID : 0000-0003-2556-9407
Ikponmwosa Odia
- Fonction : Auteur
Ilhem Boutiba Ben Boubaker
- Fonction : Auteur
Iluoreh Ahmed Muhammad
- Fonction : Auteur
Isaac Ssewanyana
- Fonction : Auteur
Isatta Wurie
- Fonction : Auteur
Iyaloo Konstantinus
- Fonction : Auteur
Jacqueline Wemboo Afiwa Halatoko
- Fonction : Auteur
James Ayei
- Fonction : Auteur
Janaki Sonoo
- Fonction : Auteur
Jean-Claude Makangara
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162497
- ORCID : 0000-0002-1791-2247
Jean-Jacques Tamfum
- Fonction : Auteur
Jean-Michel Heraud
- Fonction : Auteur
- PersonId : 13240
- IdHAL : jmheraud
- ORCID : 0000-0003-1107-0859
- IdRef : 089286790
Jeffrey Shaffer
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162498
- ORCID : 0000-0002-3941-3772
Jennifer Giandhari
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162499
- ORCID : 0000-0002-2944-4583
Jennifer Musyoki
- Fonction : Auteur
Jerome Nkurunziza
- Fonction : Auteur
Jessica Uwanibe
- Fonction : Auteur
Jinal Bhiman
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162568
- ORCID : 0000-0001-6354-4003
Jiro Yasuda
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162500
- ORCID : 0000-0001-9928-5621
Joana Morais
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1164845
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Jocelyn Kiconco
- Fonction : Auteur
John Sandi
- Fonction : Auteur
John Huddleston
- Fonction : Auteur
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John Odoom
- Fonction : Auteur
John Morobe
- Fonction : Auteur
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John Gyapong
- Fonction : Auteur
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John Kayiwa
- Fonction : Auteur
Johnson Okolie
- Fonction : Auteur
Joicymara Xavier
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254110
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Jones Gyamfi
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162505
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Joseph Wamala
- Fonction : Auteur
Joseph Bonney
- Fonction : Auteur
Joseph Nyandwi
- Fonction : Auteur
Josie Everatt
- Fonction : Auteur
Joweria Nakaseegu
- Fonction : Auteur
Joyce Ngoi
- Fonction : Auteur
Joyce Namulondo
- Fonction : Auteur
Judith Oguzie
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1162530
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Julia Andeko
- Fonction : Auteur
Julius Lutwama
- Fonction : Auteur
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Juma Mogga
- Fonction : Auteur
Justin O’grady
- Fonction : Auteur
Katherine Siddle
- Fonction : Auteur
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Kayode Adeyemi
- Fonction : Auteur
Kefentse Tumedi
- Fonction : Auteur
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Kevin Carvalho
- Fonction : Auteur
- PersonId : 1254111
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Khadija Said Mohammed
- Fonction : Auteur
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Koussay Dellagi
- Fonction : Auteur
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Kunda Musonda
- Fonction : Auteur
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- Fonction : Auteur
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Lamia Fki-Berrajah
- Fonction : Auteur
Lavanya Singh
- Fonction : Auteur
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Lenora Kepler
- Fonction : Auteur
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Leon Biscornet
- Fonction : Auteur
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Leonardo de Oliveira Martins
- Fonction : Auteur
Lucious Chabuka
- Fonction : Auteur
Luicer Olubayo
- Fonction : Auteur
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Lul Deng Ojok
- Fonction : Auteur
Lul Lojok Deng
- Fonction : Auteur
Lynette Ochola-Oyier
- Fonction : Auteur
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Lynn Tyers
- Fonction : Auteur
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Madisa Mine
- Fonction : Auteur
Magalutcheemee Ramuth
- Fonction : Auteur
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Maha Mastouri
- Fonction : Auteur
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Mahmoud Elhefnawi
- Fonction : Auteur
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Maitshwarelo Matsheka
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Malebogo Kebabonye
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Mambu Momoh
- Fonction : Auteur
Maria da Luz Lima Mendonça
- Fonction : Auteur
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Marietjie Venter
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Marietou Paye
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Martin Nyaga
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Matoke-Muhia Damaris
- Fonction : Auteur
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Maureen Mburu
- Fonction : Auteur
Maximillian Mpina
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Michael Owusu
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Michael Wiley
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Mirabeau Tatfeng
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Mohamed Abouelhoda
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Mohamed Seadawy
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Mohamed Khalifa
- Fonction : Auteur
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Mooko Marethabile Matobo
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Mounerou Salou
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Mphaphi Mbulawa
- Fonction : Auteur
Mulenga Mwenda
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Mushal Allam
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My Phan
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Nabil Abid
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Nadine Rujeni
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Nadir Abuzaid
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Nancy Elguindy
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Ndeye Marieme Top
- Fonction : Auteur
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Nédio Mabunda
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Nei-Yuan Hsiao
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Nelson Boricó Silochi
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Ngiambudulu Francisco
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Ngonda Saasa
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Nicholas Bbosa
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Nickson Murunga
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Nicole Wolter
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Nikita Sitharam
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Nnennaya Ajayi
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Noël Tordo
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Nokuzola Mbhele
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Nosamiefan Iguosadolo
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Nwando Mba
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Ojide Kingsley
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Oladiji Femi
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Olubusuyi Adewumi
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Olusola Ogunsanya
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Onwe Ogah
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Ousmane Faye
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Pamela Smith-Lawrence
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Patrick Semanda
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Paul Oluniyi
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Peter Kojo Quashie
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Peter Okokhere
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Philip Bejon
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Philippe Dussart
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Phillip Bester
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Sobajo Oguntope
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Sophie Prosolek
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Stephanie van Wyk
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Stephen Schaffner
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Stephen Kanyerezi
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Steven Rudder
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Susan Nabadda
- Fonction : Auteur
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Thanh Le-Viet
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- Fonction : Auteur
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Ugochukwu Anyaneji
- Fonction : Auteur
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Wonderful Choga
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A. Zorgani
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Zouheir Yassine
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Zoukaneirii Issa
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P. Zulu
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Zuzheng Xiang
- Fonction : Auteur
Résumé
INTRODUCTION
Investment in Africa over the past year with regard to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) sequencing has led to a massive increase in the number of sequences, which, to date, exceeds 100,000 sequences generated to track the pandemic on the continent. These sequences have profoundly affected how public health officials in Africa have navigated the COVID-19 pandemic.
RATIONALE
We demonstrate how the first 100,000 SARS-CoV-2 sequences from Africa have helped monitor the epidemic on the continent, how genomic surveillance expanded over the course of the pandemic, and how we adapted our sequencing methods to deal with an evolving virus. Finally, we also examine how viral lineages have spread across the continent in a phylogeographic framework to gain insights into the underlying temporal and spatial transmission dynamics for several variants of concern (VOCs).
RESULTS
Our results indicate that the number of countries in Africa that can sequence the virus within their own borders is growing and that this is coupled with a shorter turnaround time from the time of sampling to sequence submission. Ongoing evolution necessitated the continual updating of primer sets, and, as a result, eight primer sets were designed in tandem with viral evolution and used to ensure effective sequencing of the virus. The pandemic unfolded through multiple waves of infection that were each driven by distinct genetic lineages, with B.1-like ancestral strains associated with the first pandemic wave of infections in 2020. Successive waves on the continent were fueled by different VOCs, with Alpha and Beta cocirculating in distinct spatial patterns during the second wave and Delta and Omicron affecting the whole continent during the third and fourth waves, respectively. Phylogeographic reconstruction points toward distinct differences in viral importation and exportation patterns associated with the Alpha, Beta, Delta, and Omicron variants and subvariants, when considering both Africa versus the rest of the world and viral dissemination within the continent. Our epidemiological and phylogenetic inferences therefore underscore the heterogeneous nature of the pandemic on the continent and highlight key insights and challenges, for instance, recognizing the limitations of low testing proportions. We also highlight the early warning capacity that genomic surveillance in Africa has had for the rest of the world with the detection of new lineages and variants, the most recent being the characterization of various Omicron subvariants.
CONCLUSION
Sustained investment for diagnostics and genomic surveillance in Africa is needed as the virus continues to evolve. This is important not only to help combat SARS-CoV-2 on the continent but also because it can be used as a platform to help address the many emerging and reemerging infectious disease threats in Africa. In particular, capacity building for local sequencing within countries or within the continent should be prioritized because this is generally associated with shorter turnaround times, providing the most benefit to local public health authorities tasked with pandemic response and mitigation and allowing for the fastest reaction to localized outbreaks. These investments are crucial for pandemic preparedness and response and will serve the health of the continent well into the 21st century.
Domaines
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